Συντάχθηκε 01-06-2012 12:02
από Galateia Malandraki
Email συντάκτη: gmalandraki<στο>tuc.gr
Ενημερώθηκε:
-
Ιδιότητα: υπάλληλος ΑΡΜΗΧ.
ΠΟΛΥΤΕΧΝΕΙΟ ΚΡΗΤΗΣ
Τμήμα Ηλεκτρονικών Μηχανικών & Μηχανικών Υπολογιστών
ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ ΔΙΠΛΩΜΑΤΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ
ΒΙΓΔΙΔΕΛΗ ΘΕΟΔΩΡΑ
με θέμα
“Προσέγγιση μίγματος ειδικών μεθόδων για την ταξινόμηση γονιδίων”
“Mixture of Experts approach in gene classification”
Τετάρτη 6 Ιουνίου 2012, 5μμ
Αίθουσα 137.Π39, Κτίριο Επιστημών, Πολυτεχνειούπολη
Εξεταστική Επιτροπή
Καθ. Ζερβάκης Μιχάλης (επιβλέπων)
Καθ. Λιάβας Αθανάσιος
Αν. Καθ. Πετράκης Ευριπίδης
Περίληψη
Οι βιολογικές διεργασίες μελετώνται με τη γονιδιακή ανάλυση, η οποία καταλήγει σε μεγάλο αριθμό γονιδίων, με αποτέλεσμα να γίνονται απαραίτητες οι αυτοματοποιημένες μέθοδοι. Σε αυτή την εργασία, εξετάζουμε την επιρροή των αλγοριθμικών παραμέτρων τόσο στη δύναμη της πρόβλεψης μίας γονιδιακής υπογραφής όσο και στη διαδικασία επιλογής της ίδιας της υπογραφής. Eστιάζουμε σε μία προσέγγιση επιλογής γονιδίων, η οποία εφαρμόζεται στο σύνολο δεδομένων του ζυμομύκητα Saccharomyces cerevisiae, με αρκετά διαφορετικές παραμέτρους, και στην εκτίμηση της επιρροής της επιλεγμένης γονιδιακής υπογραφής. Πιο συγκεκριμένα, προσαρμόζουμε μία διαδικασία αναδρομικής εξάλειψης των χαρακτηριστικών, όπου σε κάθε βήμα η προγνωστική δύναμη του συνόλου των υπολοίπων γονιδίων εκτιμάται από διαφορετικούς ταξινομητές καθώς και από μίγματα αυτών. Επιπρόσθετα, πολλαπλές επαναλήψεις αυτής της διαδικασίας μας εξασφαλίζουν την εκχώρηση στατιστικής σημαντικότητας στα γονίδια η οποία βασίζεται στις σχετικές συχνότητες εμφάνισης τους. Επίσης, μελετάμε το σύστημα της συγχώνευσης ταξινομητών με σκοπό να μειώσουμε αβεβαιότητες που σχετίζονται με τον ταξινομητή που αξιολογεί τη σημαντικότητα των γονιδίων. Η διαδικασία της επιλογής γονιδίων είναι ενσωματωμένη σε ένα cross-validation σύστημα, με σκοπό να ενισχυθεί η εμπιστοσύνη στα αποτελέσματα. Εξετάζουμε τις διαφορές των γονιδιακών υπογραφών βασιζόμενοι στην πιθανή επικάλυψή τους, και επίσης τη βιολογική περιγραφή των επιλεγμένων γονιδίων, η οποία διεξάγεται με το σύστημα ταξινόμησης MIPS FunCat.
Συνημμένα:
-
DiplomatikiErgasia-vigdideli.doc
Μεταφορτώσεις: 197,
Μέγεθος: 43 KB application/msword
